NAMD (Not (just) Another Molecular Dynamics program)[1]​ es un software para dinámica molecular en paralelo diseñado para simulaciones de alto desempeño de sistemas biomoleculares. Se hizo acreedor de un premio Gordon Bell en 2002.[2]​ Está basado en objetos paralelos Charm++ y es escalable a cientos de procesadores en plataformas de punta y decenas de procesadores en cómodos clusters usando ethernet gigabit. NAMD usa el popular programa de presentación gráfica molecular VMD para configurar la simulación y analizar las trayectorias, siendo también parcialmente compatible con AMBER, CHARMM y X-PLOR.

NAMD
Información general
Tipo de programa Dinámica molecular
Desarrollador Theoretical and Computational Biophysics Group (TCB) y The Parallel Programming Laboratory (PPL)
Licencia University of Illinois license
Estado actual Con soporte
Idiomas 1
Información técnica
Programado en C++
Plataformas admitidas «x86», «x86-64»
Versiones
Última versión estable 2.9 (info) ( 30 de abril de 2012 (11 años, 10 meses y 28 días))
Enlaces

Véase también editar

Referencias editar