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Janet Thornton

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Dame Janet Maureen Thornton, DBE FRSF MedSciHon FRSC (N. el  23 de mayo de 1949)[1]​ es una científica senior en el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI), parte del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL).[2]​[3]​[4]​ Es una de las investigadoras de referencia en bioinformática estructural, haciendo uso de métodos computacionales para comprender la estructura y la función de las proteínas.[5]​[6]​[7]​[8]​

Ha sido directora del EBI de octubre de 2001 a junio de 2015, y desempeñó un papel clave en ELIXIR.[9]​

Educación

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Tras graduarse en Física por la Universidad de Nottingham, Thornton finalizó su master en biofísica en la Universidad King de Londres, y su tesis doctoral en Biofísica en el Instituto Nacional de Investigación Médica, Mill Hill, Londres en 1973.[10]​

Carrera e Investigación

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Tras finalizer su doctorado, Thornton trabajó en biofísica molecular con David Chilton Phillips en la Universidad de Oxford.[11]​[12]​ En 1978, volvió al Instituto Nacional de Investigación Médica, y posteriormente consiguió una beca en la Universidad Birbeck, que forma parte de la Universidad de Londres.

En 1990 fue nombrada Directora y Catedrática de la Unidad de Modelado y Estructura Molecular del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad de Londres, siendo a continuación también asignada a la Cátedra Bernal en el Departamento de Cristalografía en la Universidad de Birkbeck .[13]​

Thornton fue Directora del Instituto Europeo de Bioinformática de 2001 a 2015, en el Campus Wellcome Trust Genome en Hinxton, cerca de Cambridge.[14]​ Fue organizadora de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular (ISMB) y de la Conferencia Europea de Biología Computacional ECCB en Glasgow en 2004.[15]​

Su trabajo es interdisciplinar, intercalando estudios de biología estructural, bioinformática, química biológica y informática química, entre otros. Fue una pionera en el campo de la validación estructural de cristalografía de proteínas, desarrollando el conocido software “ProCheck”[16]​. Junto con Christine Orengo, introdujeron el sistema de clasificación de estructura de proteínas, CATH.[17]​[18]​[19]​[20]​[21]​[22]​

Su grupo desarrolló una herramienta de clasificación, comparación y anotación enzimática – El EC-BLAST [23]​– que calcula la similitud entre enzimas basado en las reacciones químicas capturadas por los cambios de enlaces, centros de reacción o similitudes entre ellos.[24]​

De 2008 a 2012 co-coordinó la fase preparatoria de cuatro años de ELIXIR[25]​. Hasta 2013 continúa siendo un miembro del boardde ELIXIR como delegada científica del EMBL[26]​. Su investigación ha sido financiada por el Medical Research Council, el Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) [27]​[28]​, el Wellcome Trust y la Unión Europea..

Estudiantes de Doctorado y postdoctorales

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Thornton ha supervisado varios PhD y estudios postdoctorales, incluyendo los de Julia Fischer, Shiri Freilich, Alex Gutterridge, Simon Hubbard, Abdullah Kahrman, Sergio MArtínez-Cuesta, Frances Pearl, James Torrance, Matthías Zeihm, Sara Teichmann y David Tudor Jones.

Premios y reconocimientos

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Thornton fue elegida Miembro de la Real Sociedad en 1999. Se convirtió en miebro de la Organización Europea de Biología Molecular en 2000, asociada extranjera de la US Academia Nacional de Ciencias  en 2003 y Miembro de la Academia de Ciencias Médicas en 2014. Thronton es figurante de la Universidad de Churchill, Cambridge. Desde 2017 es Miembro Honorario de la Real Sociedad de Química (honFRSC), cuya nominación lee:

“Janet Thornton se distingue por su contribución al estudio de la estructura tridimensional de las proteínas: sus estudios comparativos han ayudado al desarrollo de algoritmos usados para analizar y hacer predicciones de estructura supersecundaria y terciaria. En 1970 junto con M. J. Sternberg establecieron reglas claras para la practicidad de las unidades B-a-B y la demostración de métodos válidos para la predicción de la organización de láminas Beta. En Birkbeck desarrolló este trabajo para definir familias de conformaciones en B-hairpins y aB-links donde las estructuras habían sido asumidas previamente como aleatorias. Ha hecho unos de los análisis más exhaustivos y útiles de interacciones de proteínas a nivel de cadena lateral, permitiendo la creación de un atlas útil para el diseño de proteínas y ligandos. Este atlas se usa tanto en academia como en la industria farmacéutica. En la universidad desarrolló estudios de conformaciones y estereoquímica en procedimientos, PROCHECK, que evalúa la calidad de estructuras de proteínas definidas experimentalmente: esta herramienta se usa ampliamente para comprobar las estructuras de proteínas. Thornton presentó un método, conocido como threading, que provee una fuerte evidencia sobre la estructura terciaria de una secuencia de aminoácidos que no es homóloga de forma obvia a cualquier otra estructura conocida.

Su mención en las elecciones en la Academia de Ciencias Médicas lee:

Dame Janet Thornton es Directora del Instituto Europeo de Bioinformática y es una referente mundial en el ámbito de la Bioinformática. Ha contribuido significativamente a las ciencias médicas incrementando el entendimiento fundamental de las estructuras de proteínas y cómo contribuyen al desarrollo de enfermedades y al envejecimiento. Las herramientas y bases de datos que ha desarrollado se usan a nivel mundial en investigación básica, en académica y en compañías farmacéuticas.”

Como directora del EBI, ha sido responsable del desarrollo estratégico relacionado con el impacto de los datos de ciencias biológicas en ciencias médicas.

REFERENCIAS

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  1. ↑ Thornton, Dame Janet (M.), (born 23 May 1949), Senior Scientist, since 2001, and Director, 2001–15, now Director Emeritus, European Bioinformatics Institute, European Molecular Biology Laboratory | WHO'S WHO & WHO WAS WHO (en inglés). doi:10.1093/ww/9780199540884.001.0001/ww-9780199540884-e-37638;jsessionid=4936e805fec564d9dfea43963c169401. Consultado el 9 de octubre de 2018. 
  2. ↑ «Professor Dame Janet Thornton - Sciences & technology in the service of society». 9 de junio de 2013. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  3. ↑ «19 March 0214 - Great British bioscience pioneers – Professor Dame Janet Thornton - BBSRC». 9 de febrero de 2015. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  4. ↑ PMC, Europe. «Janet Thornton author profile - Europe PMC». europepmc.org (en inglés). Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  5. ↑ Zagorski, Nick (30 de agosto de 2005). «Profile of Janet M. Thornton». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 102 (35): 12296-12298. ISSN 0027-8424. PMC 1194944. PMID 16118281. doi:10.1073/pnas.0505819102. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  6. ↑ Biology, Genome (2012). «Women in Science». Genome Biology 13 (3): 148. ISSN 1465-6906. PMC 3439960. PMID 22405408. doi:10.1186/gb-2012-13-3-148. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  7. ↑ «Thornton Group Home Page | EBI». 18 de abril de 2011. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  8. ↑ pubmeddev. «"Thornton JM"[Author] - PubMed - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  9. ↑ «ELIXIR: a distributed infrastructure for European biological data». Trends in Biotechnology (en inglés) 30 (5): 241-242. 1 de mayo de 2012. ISSN 0167-7799. doi:10.1016/j.tibtech.2012.02.002. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  10. ↑ «The conformation of dinucleotides | Copac». copac.jisc.ac.uk (en inglés). Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  11. ↑ Thornton, Janet M.; Bayley, Peter M. (1976-05). «Conformational energy calculations for dinucleotide molecules. A systematic study of dinucleotide conformation, with application to diadenosine pyrophosphate». Biopolymers (en inglés) 15 (5): 955-975. ISSN 0006-3525. doi:10.1002/bip.1976.360150511. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  12. ↑ «Computer techniques for conformational studies of biological molecules». Computers in Biology and Medicine (en inglés) 6 (1): 23-31. 1 de enero de 1976. ISSN 0010-4825. doi:10.1016/0010-4825(76)90034-2. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  13. ↑ «Professor Janet Thornton — Birkbeck, University of London». www.bbk.ac.uk. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  14. ↑ «Janet Thornton steps down < Press releases < News < About us < EMBL-EBI». 3 de julio de 2015. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  15. ↑ «ISMB/ECCB 2004». www.iscb.org. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  16. ↑ Laskowski, R. A.; MacArthur, M. W.; Moss, D. S.; Thornton, J. M. (1 de abril de 1993). «PROCHECK: a program to check the stereochemical quality of protein structures». Journal of Applied Crystallography (en inglés) 26 (2): 283-291. ISSN 0021-8898. doi:10.1107/S0021889892009944. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  17. ↑ «CATH – a hierarchic classification of protein domain structures». Structure (en inglés) 5 (8): 1093-1109. 15 de agosto de 1997. ISSN 0969-2126. doi:10.1016/S0969-2126(97)00260-8. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  18. ↑ Marx, Vivien (2014-02). «Janet Thornton». Nature Methods (en inglés) 11 (2): 115-115. ISSN 1548-7091. doi:10.1038/nmeth.2831. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  19. ↑ «Conformation of β-hairpins in protein structures: A systematic classification with applications to modelling by homology, electron density fitting and protein engineering». Journal of Molecular Biology (en inglés) 206 (4): 759-777. 20 de abril de 1989. ISSN 0022-2836. doi:10.1016/0022-2836(89)90583-4. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  20. ↑ Thornton, Janet M.; Singh, Juswinder; Campbell, Simon; Blundell, Tom L. (1 de diciembre de 1988). «Protein-protein recognition via side-chain interactions». Biochemical Society Transactions (en inglés) 16 (6): 927-930. ISSN 0300-5127. PMID 3224756. doi:10.1042/bst0160927. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  21. ↑ Blundell, T. L.; Sibanda, B. L.; Sternberg, M. J. E.; Thornton, J. M. (1987-03). «Knowledge-based prediction of protein structures and the design of novel molecules». Nature (en inglés) 326 (6111): 347-352. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/326347a0. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  22. ↑ Reeves, Gabrielle A.; Eilbeck, Karen; Magrane, Michele; O'Donovan, Claire; Montecchi-Palazzi, Luisa; Harris, Midori A.; Jimenez, Rafael C.; Prlic, Andreas et al. (1 de diciembre de 2008). «The Protein Feature Ontology: A Tool for the Unification of Protein Annotations». Bioinformatics (Oxford, England) 24 (23): 2767-2772. ISSN 1367-4803. PMC 2912506. PMID 18936051. doi:10.1093/bioinformatics/btn528. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  23. ↑ Rahman, Syed Asad; Cuesta, Sergio Martinez; Furnham, Nicholas; Holliday, Gemma L; Thornton, Janet M (12 de enero de 2014). «EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions». Nature Methods (en inglés) 11 (2): 171-174. ISSN 1548-7091. doi:10.1038/nmeth.2803. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  24. ↑ Rahman, Syed Asad; Torrance, Gilliean; Baldacci, Lorenzo; Martínez Cuesta, Sergio; Fenninger, Franz; Gopal, Nimish; Choudhary, Saket; May, John W. et al. (1 de julio de 2016). «Reaction Decoder Tool (RDT): extracting features from chemical reactions». Bioinformatics 32 (13): 2065-2066. ISSN 1367-4803. PMC 4920114. PMID 27153692. doi:10.1093/bioinformatics/btw096. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  25. ↑ «ELIXIR: a distributed infrastructure for European biological data». Trends in Biotechnology (en inglés) 30 (5): 241-242. 1 de mayo de 2012. ISSN 0167-7799. doi:10.1016/j.tibtech.2012.02.002. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  26. ↑ «ELIXIR: a distributed infrastructure for European biological data». Trends in Biotechnology (en inglés) 30 (5): 241-242. 1 de mayo de 2012. ISSN 0167-7799. doi:10.1016/j.tibtech.2012.02.002. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  27. ↑ «19 March 0214 - Great British bioscience pioneers – Professor Dame Janet Thornton - BBSRC». 9 de febrero de 2015. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
  28. ↑ «GtR». 10 de marzo de 2015. Consultado el 10 de octubre de 2018. 
 
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