De acuerdo con la mayoría de estudios filogenéticos, Chromista constituye un grupo [[parafiléticopolifilético]] conformado por los descendientes del supergrupo [[Corticata]] exceptuando [[Archaeplastida]] (Plantae). La unidad de Corticata está bien consensuada, así como la del [[supergrupo SAR]], pero en el caso de [[Hacrobia]], podría tratarse de un grupo monofilético (visión mayoritaria)<ref name="Caval-Sm2015"/> o parafiléticopolifilético,<ref>Fabien Burki et al. 2012, [http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/279/1736/2246 The evolutionary history of haptophytes and cryptophytes: phylogenomic evidence for separate origins.] The Royal Society 2012 DOI: 10.1098/rspb.2011.2301</ref> y también es probable que Chromista sea monofilético:<ref name ="Zhao">Sen Zhao et al. 2012, [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3351787/ Collodictyon—An Ancient Lineage in the Tree of Eukaryotes.] Mol Biol Evol. 2012 Jun; 29(6): 1557–1568. doi: 10.1093/molbev/mss001 PMCID: PMC3351787</ref>
