Se [[Suicidio|suicidó]] dos días después del aniversario del [[asalto al Cuartel Moncada]] (algunos dicen que fue el 26, y el gobierno cubano dijo el 28), y a raíz de la [[Crisis de la embajada peruana en La Habana de 1980]], el [[Éxodo del Mariel]] cuando se produjo un éxodo de 125000 cubanos hacia Estados Unidos y la [[Masacre del Río Canímar]]. Dejó una carta dirigida a Fidel Castro, con el que había discutido días antes, donde le dice que él traicionó la Revolución cubana.<ref>{{Cita web|url=https://www.radiotelevisionmarti.com/a/haydee-santamaria-suicidio-mas-famoso-de-cuba/161577.html|título=Haydée Santamaría: el suicidio más famoso de la revolución cubana|fechaacceso=2021-07-15|sitioweb=Radio y Televisión Martí {{!}} RadioTelevisionMarti.com|idioma=es}}</ref>La versión oficial dice que murió en la casa que compartía con sus hijos, a consecuencia de un disparo en la cabeza realizado con una pistola. A pesar de su condición de [[Veterano|veterana]] de la revolución, sus restos no fueron velados con honores oficiales, en consonancia con el código de honor político del gobierno cubano que condena los suicidios de sus dirigentes.<ref>{{Cita web|url=https://www.14ymedio.com/blogs/desde_aqui/carta-despedida-Haydee-Santamaria_7_2919977974.html|título=La carta de despedida de Haydée Santamaría|fechaacceso=2021-07-15|sitioweb=14ymedio|idioma=es}}</ref>
