Pedro Antonio Marín Marín nació en [[Génova (Quindío)|Génova]], en ese entonces, municipio del departamento de [[Viejo Caldas|Caldas]] (actualmente pertenece al departamento del [[Quindío]]). Existe controversia sobre su fecha de nacimiento, y no está claro si tuvo lugar en mayo de 1928 o de 1930. Era hijo de campesinos liberales que vivían en Ceilán ([[Valle del Cauca]]). Su padre era Pedro Pablo Marín Quiceno y su madre era Rosa Adelia Marín Gallego y su padrastro Ramiro Betancourt. Sus hermanos eran Rosa Helena, Jesús Antonio, Obdulia y Rosa María.<ref name="RSEMANA2">{{Cita web |url=http://www.semana.com/wf_InfoArticulo.aspx?idArt=112107 |título=Un campesino en armas |autor=Revista ''Semana'' |fechaacceso=24 de mayo de 2008 |urlarchivo=https://web.archive.org/web/20080925124506/http://www.semana.com/wf_InfoArticulo.aspx?idArt=112107 |fechaarchivo=25 de septiembre de 2008 }}</ref>
Su abuelo Ángel Marín, [[antioqueño]] de tendencias liberales, fue combatiente en la [[Guerra de los Mil Días]].<ref name="RSEMANA2" /> Marín cursó hasta quinto de primaria en la escuela. A los 13 años se fue de casa.<ref name="RSEMANA2" />
