Popeye fue elegido por [[Houston Rockets]] en el puesto 100041 de 2ª ronda del [[draft de 1992]]. Tras la elección, Houston tradeó sus derechos a [[Dallas Mavericks]] a cambio de los derechos de [[Eric Riley]]. Jones jugó con los Mavericks durante 3 temporadas. Esas fueron las mejores de su carrera deportiva. Antes de debutar en la [[Temporada 1993-94 de la NBA|campaña 1993-94]] jugó un año en [[Italia]]. Como novato promedió 5.8 puntos y 7.5 rebotes, mientras que como sophomore en la [[Temporada 1994-95 de la NBA|1994-95]] se fue hasta los 10.3 puntos, 10.6 rebotes y 2 asistencias. En la [[Temporada 1995-96 de la NBA|1995-96]] siguió mejorando sensiblemente sus números con 11.3 puntos, 10.8 rebotes y 1.9 asistencias.
En [[1996]] fue traspasado a [[Toronto Raptors]] a cambio, básicamente, de [[Jimmy King]]. En la franquicia canadiense estaría dos temporadas, aunque en la [[Temporada 1997-98 de la NBA|1997-98]] sólo pudo jugar 14 partidos.
