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Los cuellos de botella, pueden ocurrir frecuentemente durante el ciclo de vida de los [[Virus ARN|virus de ARN]]. En las [[Infección|infecciones]], los cuellos de botella crean diversidad genética en las [[Epidemia|epidemias]]; y se ha demostrado que ejercen influencia sobre el efecto de la [[Recombinación genética|recombinación]] y la [[Transferencia genética horizontal|transferencia horizontal de genes]], así como en la resistencia a drogas. Los cuellos de botella pueden además reducir la [[virulencia]] de [[patógenos]] y su [[Adaptación biológica|adaptación]] a nuevos huéspedes, puesto que incrementan la tasa con la cual las [[Mutación|mutaciones]] atenuadas se fijan en una población.<ref>{{Cita publicación|url=http://jvi.asm.org/content/78/19/10582|título=Genetic Bottlenecks Reduce Population Variation in an Experimental RNA Virus Population|apellidos=Li|nombre=Hongye|apellidos2=Roossinck|nombre2=Marilyn J.|fecha=1 de octubre de 2004|publicación=Journal of Virology|volumen=78|número=19|páginas=10582–10587|fechaacceso=27 de mayo de 2017|idioma=en|issn=0022-538X|doi=10.1128/JVI.78.19.10582-10587.2004|pmc=516416|pmid=15367625}}</ref>
== El ejemplo del guepardoleopardo ==
Un ejemplo típico de cuello de botella natural es el que sufrió el leopardo
Un ejemplo típico de cuello de botella natural es el que sufrió el [[guepardo]] (''Acinonyx jubatus'') durante las [[glaciación|glaciaciones]] del [[Pleistoceno]]. En épocas precedentes, los guepardos estaban mucho más diversificados y eran más abundantes, tanto que su área de distribución abarcaba toda [[África]], gran parte de [[Eurasia]] e incluso [[América del Norte]]. De entre las distintas especies de guepardos que existieron en el [[Plioceno|Plio]]-Pleistoceno, la que dio lugar al guepardo actual fue ''Acinonyx pardinensis'', un animal de gran tamaño, más robusto pero menos veloz que el actual, disperso por África, sur de [[Europa]] y [[Oriente Medio]]. Con la llegada de los hielos, gran parte del hemisferio norte se congeló o pasó a un clima frío ([[taiga]], [[tundra]], [[estepa]]), mientras que en las regiones tropicales, la falta de agua retenida en los glaciares polares provocó un clima más seco. Como consecuencia, la mayor parte de los guepardos se extinguieron y solo quedaron unos pocos miles de ''A. pardinensis'' (o quizá, solo unos cientos) en Oriente Próximo y parte de África, mucho más delgados y estilizados (consumiemdo así menos recursos) y veloces (pudiendo de este modo cazar animales pequeños y rápidos, más abundantes en condiciones de escasez) que la forma característica de la especie original. Habían perdido rápidamente muchos caracteres hasta entonces normales, que fueron sustituidos por otros ''raros'' (delgadez, tamaño pequeño, mayor velocidad) que hasta entonces eran eliminados o simplemente pasados por alto por la selección natural, y que ahora eran precisamente los más adecuados para sobrevivir. En la actualidad, la nueva especie resultante, ''Acinonyx jubatus'', es uno de los [[mamífero]]s con menor diversidad génica, hasta el punto de que los individuos de esta especie son fácilmente contagiables de enfermedades por otros y que apenas sufren rechazo de órganos cuando se les trasplantan. Por si fuera poco, el guepardo ha sido cazado y expulsado de diversas zonas debido al avance de la agricultura, disminuyendo aún más su población.
== Cuellos de botella artificiales ==
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