En mayo de 2018, luego de haber asumido su cargo como Ministro, fue denunciado ena la Justicia por un supuesto caso de abuso sexual, que habría sido cometido en 1983, cuando la supuesta víctima teníaera 13una añosniña yde el acusado 1613 años.<ref>{{cita web|apellidos1=Redacción de Diario Registrado|título=Denuncian por abuso sexual al ministro de Educación de la Nación|url=https://www.diarioregistrado.com/politica/denuncian-por-abuso-sexual-al-ministro-de-educacion-de-la-nacion_a5aea319791449c160551f7eb|fecha=2 de mayo de 2018|fechaacceso=2 de julio de 2018}}<br />• {{Cita noticia|título=Silencio de Finocchiaro ante la denuncia de violación en su contra|url=https://www.urgente24.com/276613-silencio-de-finocchiaro-ante-la-denuncia-de-violacion-en-su-contra|fechaacceso=9 de junio de 2018|periódico=Urgente24|idioma=es}}<br />• {{Cita web|url=http://www.politicajudicial.com/denuncia-de-violacion-contra-finocchiaro-ministro-de-educacion-de-la-nacion/|título=Denuncia de violación contra Finocchiaro, ministro de Educación de la Nación – Politica Judicial|fechaacceso=9 de junio de 2018|sitioweb=www.politicajudicial.com|idioma=es-ES}}<br />• {{Cita noticia|apellidos=REALPOLITIK.com|título=En una entrevista cara a cara, la denunciante confirmó lo sucedido: “Alejandro Finocchiaro me violó”|url=https://realpolitik.com.ar/nota/31201/en_una_entrevista_cara_a_cara_la_denunciante_confirmo_lo_sucedido_alejandro_finocchiaro_me_violo/|fechaacceso=10 de junio de 2018|idioma=es}}<br />• {{Cita web|url=http://www.eldiariodelapampa.com.ar/index.php/107-portada/destacadas/43731-denuncian-por-abuso-sexual-al-ministro-de-educacion-de-la-nacion|título=Denuncian por abuso sexual al ministro de Educación de la Nación - El Diario de La Pampa|fechaacceso=10 de junio de 2018|sitioweb=www.eldiariodelapampa.com.ar|idioma=es-es}}<br />• {{cita web|url=http://www.infobaires24.com.ar/escndalo-en-cambiemos-denuncian-al-ministro-finocchiaro-por-abuso-sexual/ |título=Escándalo en Cambiemos: Denuncian al ministro Finocchiaro por abuso sexual |publicación=InfoBaires24 |fecha=26 de abril de 2018}}<br />• {{cita web |url=http://www.agenciapacourondo.com.ar/generos/denunciaron-en-la-justicia-al-ministro-de-educacion-alejandro-finocchiaro-por-violacion |título=Denunciaron en la Justicia al ministro de Educación Alejandro Finocchiaro por violación |publicación=APU |editorial=Agencia Paco Urondo |fecha=8 de mayo de 2018 }}</ref> Como el hecho no fue denunciado en aquel momento, ni pudo ser probado, el juez de garantías, a pedido del fiscal, desestimódeclaró la prescripción de la denuncia por haber transcurrido 35 años.<ref>{{Cita web|url=http://www.meridianoactual.com/noticias/val/11692-32/la-justicia-desestim%C3%B3-una-denuncia-contra-el-ministro-finocchiaro.html|título=La Justicia desestimó una denuncia contra el ministro Finocchiaro|fechaacceso=30 de agosto de 2018|sitioweb=www.meridianoactual.com}}</ref>
