Mientras que las [[filogenia|relaciones filogenéticas]] del resto de los [[paleognato]]s no han sido aún aclaradas, tanto los estudios moleculares como morfológicos coinciden en que los casuarios forman un [[clado]] con los emúes[[emú]]es.<ref>Harshman, J. ''et al.'' (2008) [http://www.pnas.org/content/105/36/13462.full.pdf+html Phylogenomic evidence for multiple losses of flight in ratite birds]. ''PNAS'' 105:13462-12467.</ref><ref>Hackett S. J. ''et al.'' (2008) [http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/320/5884/1763 A Phylogenomic Study of Birds Reveals Their Evolutionary History]. ''Science'' 320(5884):1763-1768.</ref> Por otra parte, la posición de este grupo con respecto a los otros paleognatos varía según los estudios de datos moleculares (los cuales establecen al clado como el grupo hermano de los [[Apteryx|kiwis]]) y morfológicos.<ref>Livezey, B. C. & Zusi, R. L. (2007) [https://web.archive.org/web/20130406083649/http://biology-web.nmsu.edu/houde/Livezey%26Zusi_2007.pdf Higher-order phylogeny of modern birds (Theropoda, Aves: Neornithes) based on comparative anatomy. II. Analysis and discussion]. ''Zool. J. Linn. Soc.'' 149:1-95.</ref>
