Mantiene una fuerte rivalidad con [[Sportivo Italiano]], [[Club Atlético Estudiantes|Estudiantes BA]], [[Club Atlético All Boys|All Boys]] y [[Club Almagro|Almagro]]. También rivalizan sus aficionados con [[Club Atlético Tigre|Tigre]] y [[Club Deportivo Morón| Deportivo Morón]]
El primer rival que tuvo el club en su historia es [[Club Deportivo Morón|Morón]], debido a que en aquella época el municipio de [[partido de General Sarmiento|General Sarmiento]] era limítrofe con el [[partido de Morón]] (luego se crearon los partidos de [[partido de Ituzaingó|Ituzaingó]] y [[partido de Hurlingham|Hurlingham]]).
Otro rival es [[Club Atlético Tigre|Tigre]], por la cercanía entre ambos y por su amistad con el ''Gallito''. Los últimos enfrentamientos ante estos equipos datan del 2003 jugando por la [[Primera B (Argentina)|Primera B Metropolitana]].
Otras rivalidades de San Miguel son [[Club Atlético Colegiales (Munro)|Colegiales]], [[Club Atlético Chacarita Juniors|Chacarita Juniors]], [[Club Atlético Nueva Chicago|Nueva Chicago]], [[Club Atlético Atlanta|Atlanta]], [[Club Atlético Estudiantes|Estudiantes BA]], [[Club Atlético All Boys|All Boys]] y [[Club Almagro|Almagro]].
