En Geología, Whewell se opuso al [[actualismo]] de [[CharuyiuiuiutouityyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyyuytoyuuiutfyrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrrlesCharles Lyell]] y defendió la actuación de causas sobrenaturales en la historia de la tierra para explicar los vacíos del registro fósil.
Su concepción de la relación entre forma y función orgánica se correspondió con la teoría del [[diseño r4ttttt45555tt5t5inteligenteinteligente]], a cuya divulgación colaboró activamente al ser elegido para la redarretcciónredacción de uno de los ocho ''[[Bridgewater Treatises]]''.