Diferencia entre revisiones de «Isomería conformacional»
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En [[química orgánica]], los '''isómeros conformacionales''' o '''confórmeros''' son [[estereoisómero]]s que se caracterizan por poder interconvertirse (modificar su orientación espacial, convirtiéndose en otro [[isómero]] de la misma [[molécula]]) a temperatura ambiente, por rotación en torno a [[enlace químico|enlaces]] simples. Estas conformaciones se denominan: anti, eclipsada o alternada. Son compuestos que, generalmente, no pueden aislarse físicamente, debido a su facilidad de interconversión.
El análisis conformacional es la exploración de todos los confórmeros que se pueden obtener de una molécula dada al realizar torsiones alrededor de enlaces sencillos (grados de libertad conformacionales), observando los cambios en la energía molecular asociados a esas torsiones.
==Tipos de isomería conformacional==
[[File:Butane conformations.jpg|thumb|420px|Diagrama de energía libre del butano en función del ángulo diedro.]]
El [[butano]] tiene tres [[rotámero]]s: dos confórmeros ''gauche'', que son [[enantioméricos]] y un
Algunos ejemplos importantes de Isomería conformacional incluyen:
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*Conformación del anillo.
**[[Conformación del ciclohexano|Conformaciones del ciclohexano]] con confórmeros de silla y bote.
**[[Conformaciones de hidratos
*[[Atropisomerismo]], debido a la rotación restringida sobre un enlace una molécula puede ser quiral.
*[[Plegamiento de moléculas]], donde algunas formas son estables y funcionales, pero otros no lo son.
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==Aislamiento u observación de los isómeros conformacionales==
* Los [[atropoisomeros]] pueden ser bastante estables en función de los efectos estéricos, estos fueron los primeros isómeros conformacionales en identificarse. En el sistema de antropoisómeros [[
*En [[derivados del ciclohexano]], los rotámeros de dos sillas se interconvierten con tasas del orden de 105ring lanzamientos/seg, que evidentemente impide su separación.El confórmero ecuatorial se cristaliza selectivamente y cuando estos cristales se disuelven a temperaturas muy bajas, uno puede supervisar directamente el enfoque de equilibrio por RMN.
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== Reacciones dependientes de la conformación ==
La velocidad de reacción es altamente dependiente de la conformación de los reactivos. Este tema es especialmente bien dilucidado en química orgánica. Un ejemplo es proporcionado por las [[reacción de eliminación|reacciones de eliminación]], que implican la eliminación simultánea de un protón y un grupo saliente desde posiciones vecinales bajo la influencia de una base. El mecanismo requiere que los átomos o [[grupos salientes]] sigan trayectorias antiparalelas. Para los sustratos de la cadena abierta se cumple este requisito geométrico por al menos uno de los tres confórmeros escalonados. Para algunos sustratos cíclicos, sin embargo, un acuerdo antiparalelo puede no ser alcanzable en función. [[
[[File:E2 14tBuchexCl.png|center]]
El isómero ''trans'' puede alcanzar la configuración antiperiplanar sólo a través del confórmero axial desfavorecido, por lo tanto, no da la reacción de eliminación. El isómero ''cis'' ya está en la geometría correcta en su conformación más estable, por lo tanto, da la reacción de eliminación fácilmente.
== Bibliotecas de rotámeros de proteínas ==
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Una biblioteca de rotámeros es una colección de rotámeros para cada tipo de residuo en proteínas, con la cadena lateral y los grados de libertad. Las bibliotecas de rotámeros generalmente contienen información sobre la conformación y frecuencia de una cierta conformación. A menudo, las bibliotecas también contendrán información sobre la variación de ángulos diedro-medios o modos que pueden utilizarse en la toma de muestras.
Los ángulos diedros de la cadena lateral no se distribuyen uniformemente pero casi todos los tipos de cadena lateral, los ángulos χ, se producen en racimos apretados alrededor de ciertos valores. Las bibliotecas de rotámeros por lo tanto, generalmente, derivan del análisis estadístico de la cadena lateral de conformaciones en conocidas estructuras de proteínas, mediante la observación de conformaciones de los grupos o dividiendo el espacio del ángulo diedro en bandejas, y determinando una conformación promedio en cada ubicación. Esta división suele ser por motivos de física-química, como en las divisiones para la rotación sobre los enlaces
Las bibliotecas de rotámeros pueden ser independientes de la columna vertebral, dependientes de la estructura secundaria o dependientes de la columna vertebral. Las distinciones se hacen dependiendo de si los ángulos diedros para los rotámeros o sus frecuencias dependen de la conformación de la red local o no. Las bibliotecas de rotámeros independientes de la columna vertebral no hacen referencia a la conformación de la columna vertebral y se calculan en todas las cadenas por el lado disponible de un tipo determinado. Las bibliotecas secundarias con estructura dependiente presentan diferentes ángulos diedros o frecuencias de rotámeros para la α-hélice, β-hoja o estructuras secundarias de bobina. Las bibliotecas dependientes de la columna vertebral de rotámeros presentan conformaciones o frecuencias que dependen de la conformación de la columna vertebral local definida por la columna vertebral de los ángulos diedros ϕ y ψ, independientemente de la estructura secundaria. Finalmente, como una variante de las bibliotecas dependientes de la columna vertebral de rotámeros, existen en forma de rotámeros de posición específica los definidos por un fragmento de normalmente 5 aminoácidos de longitud, donde se examina la conformación de la cadena de lado del residuo central.
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