Existen varias versiones y mitos sobre la muerte que sufrió Valdivia. Según [[Jerónimo de Vivar]], el toqui [[Caupolicán]] pidió personalmente la ejecución de Valdivia, que fue muerto con una lanza y su cabeza puesta en una lanzaella, exhibiéndola a los otros españoles.<ref>[[Jerónimo de Vivar]], Capítulo CXV. Vivar dice que, según los indios que habían estado en la batalla, ninguno de los españoles había sobrevivido.</ref>[[Alonso de Góngora Marmolejo]] escribe que Valdivia ofreciendo como rescate por su vida, prometió que evacuaría los establecimientos españoles en sus tierras y les daría grandes manadas de animales; pero según la versión de Góngora Marmolejo, "esto fue rechazado y los mapuches cortaron sus antebrazos, los asaron y comieron delante de él antes de asesinarlos a él y al sacerdote".<ref> Marmolejo, Capítulo XIV.</ref>[[Pedro Mariño de Lobera]] también escribió que Valdivia ofreció evacuar las tierras mapuches<ref>''Historia del pueblo mapuche: (siglo XIX y XX)'' pag.35 [[José Bengoa Cabello]]</ref> pero poco después fue muerto por un guerrero vengativo llamado [[Leucotón]]<ref>''Historia del pueblo mapuche: (siglo XIX y XX)'' pag.34 José Bengoa</ref>con un gran mazazo en su cabeza, tras decir que Valdivia no mantendría su palabra una vez libre. Los historiadores dicen que Leucotón fue nominado para cumplir con la sentencia de muerte y se usó esta porque era la menos sanguinaria, ya que Leucotón era un experto macero y mataba limpiamente de un solo golpe.<ref name=autogenerated1>Lobera, Capítulo XLIII.</ref>Lobera también dice, circuló una historia en esos días por Chile en la que Valdivia fue muerto dándole a beber el oro fundido que los españoles deseaban tanto; quemando sus interioresentrañas.<ref name=autogenerated1 /><ref>''Historia del pueblo mapuche: (siglo XIX y XX)'' pág.35 José Bengoa</ref>
Una leyenda posterior dice: [[Lautaro]] llevó al campo mapuche a Valdivia y le dio muerte después de tres días de atroces torturas, extrayéndole a carne viva el corazón y comiéndoselo junto a los toquis.<ref>''Historia del pueblo mapuche: (siglo XIX y XX)'' José Bengoa</ref>Su cráneo fue extraído y sirvió como trofeo al ser usado como vasija contenedora de [[chicha]],<ref>Esto es poco probable, ya que era una costumbre noreuropea. Los vikingos, asesinaban a sus víctimas para aterrorizarlas usando sus cráneos para beber. No en vano todavía se dice ''Skoll'' (''Calavera'') en los países nórdicos para libarbrindar.</ref><ref>''Historia del pueblo mapuche: (siglo XIX y XX)'' pag.35 José Bengoa</ref>entre los principales toquis; fue devuelto medio siglo más tarde junto al de [[Martín Óñez de Loyola]] a los españoles como prueba de pacificación por el cacique [[Pelantarú]].
