Anexo:Trayectoria del Mérida Unión Deportiva
| Temporada | Categoría |  puesto |
 Copa |
Notas |
|---|---|---|---|---|
| 1990-91 | Regional Preferente de Extremadura | 1º 
|
||
| 1991-92 | 3ª División | 6º | ||
| 1992-93 | 3ª División | 10º | ||
| 1993-94 | 3ª División | 3º | ||
| 1994-95 | 3ª División | 9º | ||
| 1995-96 | 3ª División | 4º | ||
| 1996-97 | 3ª División | 5º | ||
| 1997-98 | 3ª División | 2º | ||
| 1998-99 | 3ª División | 4º | ||
| 1999-00 | 3ª División | 1º | ||
| 2000-01 | 3ª División | 2º
|
||
| 2001-02 | 2ª División B | 4º | ||
| 2002-03 | 2ª División B | 13º | 1ª Ronda | |
| 2003-04 | 2ª División B | 18º 
|
||
| 2004-05 | 3ª División | 1º
|
Campeón Copa de Extremadura | |
| 2005-06 | 2ª División B | 9º | 2.ª ronda | |
| 2006-07 | 2ª División B | 15º | ||
| 2007-08 | 2ª División B | 4º | ||
| 2008-09 | 2ª División B | 7º
|
2.ª ronda | Desciende por impagos |
| 2009-10 | 3ª División | 5º | 3ª Ronda | |
| 2010-11 | 3ª División | 5º | ||
| 2011-12 | 3ª División | 8º | ||
| 2012-13 | 3ª División | 6º | ||
| Temporada | Categoría | puesto |
Copa |
Notas |